Η έγκριση μιας αίτησης είναι σημαντικό βήμα, όμως η επιχορήγηση δεν καταβάλλεται αμέσως. Στα περισσότερα προγράμματα η επιχείρηση υλοποιεί πρώτα την επένδυση, πληρώνει τις δαπάνες και στη συνέχεια λαμβάνει το ποσό της ενίσχυσης, αφού γίνει έλεγχος. Η καλή οργάνωση σε αυτή τη φάση καθορίζει πόσο γρήγορα θα γίνει η πληρωμή.
Ορισμένα προγράμματα προβλέπουν προκαταβολή, συνήθως με την κατάθεση εγγυητικής επιστολής. Άλλα επιτρέπουν ενδιάμεσα αιτήματα πληρωμής, όταν ολοκληρωθεί ένα μέρος του έργου. Οι όροι αναφέρονται στον οδηγό του προγράμματος και στην απόφαση ένταξης.
Κάθε δαπάνη πρέπει να αποδεικνύεται με τιμολόγιο και με παραστατικό πληρωμής μέσω τραπεζικού λογαριασμού. Τα στοιχεία πρέπει να συμφωνούν με τον εγκεκριμένο προϋπολογισμό. Αλλαγές σε προμηθευτές ή σε είδη εξοπλισμού συνήθως απαιτούν αίτημα τροποποίησης πριν γίνουν. Ένας οργανωμένος φάκελος με όλα τα παραστατικά από την πρώτη ημέρα διευκολύνει σημαντικά τον έλεγχο.
Μετά την ολοκλήρωση, η επιχείρηση υποβάλλει αίτημα επαλήθευσης. Ακολουθεί διοικητικός έλεγχος των εγγράφων και συχνά επιτόπια επίσκεψη, ώστε να επιβεβαιωθεί ότι η επένδυση έγινε όπως εγκρίθηκε. Όταν ο έλεγχος ολοκληρωθεί χωρίς ελλείψεις, εκδίδεται η απόφαση πληρωμής. Αν διαπιστωθούν ελλείψεις, ζητούνται συμπληρωματικά στοιχεία, κάτι που καθυστερεί την πληρωμή.
Πολλά προγράμματα ορίζουν υποχρεώσεις για ένα διάστημα μετά την ολοκλήρωση, όπως η διατήρηση των θέσεων εργασίας ή του εξοπλισμού. Η τήρησή τους είναι απαραίτητη, ώστε να μη ζητηθεί επιστροφή μέρους της ενίσχυσης. Συνήθως προβλέπονται επίσης υποχρεώσεις δημοσιότητας, όπως η ανάρτηση αφίσας ή πινακίδας για τη χρηματοδότηση.
Η Entec Consultants υποστηρίζει τις επιχειρήσεις και μετά την έγκριση, στα αιτήματα τροποποίησης, στην τεκμηρίωση των δαπανών και στον έλεγχο, με στόχο την ταχύτερη δυνατή απορρόφηση των κονδυλίων.